Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms