Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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