Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CHD4Q14839 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms