Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
RRP1BQ14684 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms