Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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FAT1Q14517 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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FAT1Q14517 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
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FAT1Q14517 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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FAT1Q14517 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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FAT1Q14517 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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FAT1Q14517 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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FAT1Q14517 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
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