Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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