Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP8Q14114 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms