Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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