Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
APOFQ13790 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
APOFQ13790 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms