Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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PTCH1Q13635 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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PTCH1Q13635 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTCH1Q13635 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTCH1Q13635 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTCH1Q13635 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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