Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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