Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms