Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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