Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms