Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RLFQ13129 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RLFQ13129 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RLFQ13129 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RLFQ13129 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms