Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PRDM2Q13029 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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