Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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