Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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