Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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LTBP3Q9NS15 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LTBP3Q9NS15 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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