Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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FOXQ1Q9C009 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXQ1Q9C009 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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