Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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CCDC47Q96A33 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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CCDC47Q96A33 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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CCDC47Q96A33 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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CCDC47Q96A33 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC47Q96A33 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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