Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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