Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms