Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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