Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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