Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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