Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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CDKN3Q16667 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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CDKN3Q16667 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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CDKN3Q16667 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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CDKN3Q16667 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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