Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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