Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNAPC1Q16533 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNAPC1Q16533 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNAPC1Q16533 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNAPC1Q16533 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNAPC1Q16533 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNAPC1Q16533 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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SNAPC1Q16533 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNAPC1Q16533 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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