Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RPE65Q16518 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms