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| RPE65 | Q16518 | SNORA3.3-201 | ENST00000408712 | 125 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RPE65 | Q16518 | AC078974.1-201 | ENST00000411597 | 223 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RPE65 | Q16518 | ANKRD36C-202 | ENST00000456556 | 5428 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| RPE65 | Q16518 | CD80-201 | ENST00000264246 | 2725 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RPE65 | Q16518 | ESCO1-201 | ENST00000269214 | 4523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| RPE65 | Q16518 | GNG5P1-201 | ENST00000255500 | 204 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | CRISP3-203 | ENST00000371159 | 872 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | MEIG1-201 | ENST00000378240 | 507 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | EEF1E1-201 | ENST00000379715 | 1077 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | RNU6-629P-201 | ENST00000384061 | 103 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | U1.1-201 | ENST00000384101 | 164 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| RPE65 | Q16518 | CCNG1P1-201 | ENST00000406783 | 885 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| RPE65 | Q16518 | C1GALT1C1L-201 | ENST00000475092 | 1172 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | MTND1P3-201 | ENST00000484956 | 952 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| RPE65 | Q16518 | Y_RNA.672-201 | ENST00000516289 | 104 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| RPE65 | Q16518 | AP003033.1-201 | ENST00000527244 | 415 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | SPAG11B-207 | ENST00000528168 | 481 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | AC113192.5-201 | ENST00000528779 | 486 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | AC084819.1-201 | ENST00000537293 | 424 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | AC123904.2-201 | ENST00000548059 | 300 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| RPE65 | Q16518 | AL121603.1-201 | ENST00000553815 | 142 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | NDUFB1-204 | ENST00000555441 | 458 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | AC034105.4-201 | ENST00000568304 | 277 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| RPE65 | Q16518 | AC099566.1-211 | ENST00000595188 | 737 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | AC087241.4-201 | ENST00000612441 | 480 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | AC103858.2-201 | ENST00000621471 | 543 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | UBE2D3-233 | ENST00000618836 | 3472 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | LLPH-201 | ENST00000266604 | 7746 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | PPHLN1-208 | ENST00000449194 | 1583 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| RPE65 | Q16518 | ABCC9-201 | ENST00000261200 | 8293 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |