Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SSX1Q16384 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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