Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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