Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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