Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC85BQ15834 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms