Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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