Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms