Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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