Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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