Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms