Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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NEDD9Q14511 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NEDD9Q14511 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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