Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms