Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms