Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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APOFQ13790 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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APOFQ13790 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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APOFQ13790 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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APOFQ13790 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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APOFQ13790 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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APOFQ13790 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
APOFQ13790 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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