Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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