Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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