Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms