Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms