Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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