Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms