Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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